برخی مسئولان دولت یازدهم نسبت به رواج بی اخلاقیها در ماجرای پرداخت های میلیونی و متهم کردن برخی افراد اعتراض کردند. به گزارش آفتاب یزد، در حالی که با افشای برخی تخلفات صورت گرفته در پرداخت حقوقهای نامتعارف به برخی مدیران، مقامات بلند پایه دولت یازدهم از رئیس جمهوری گرفته تا معاون اول رئیس جمهور و وزرای مربوطه به سرعت و دقت در حال پیگیری تخلفات صورت گرفته هستند، اما در این بین برخی رسانه ها با انتشار اخباری ناموثق پای افرادی را به این ماجرا باز کرده اند. در همین حال ، علی ربیعی، وزیر کار نیز با انتقاد از این رویه فوق، عنوان کرده که عده ای با سو استفاده از فضای به پوجود آمده ، جو ناجوانمردانهای علیه دولت به وجود آورده اند.
از آن سو، علی طیب نیا، وزیر اقتصاد نیز از رفتار برخی رسانهها و رویه تخریبی آنها انتقاد کرده است.
از سوی دیگر، محمدباقر نوبخت، سخنگوی دولت نیز خبر داده است که موضوع تخلفات صورت گرفته به دقت پیگیری می شود و قرار است به زودی مدیران متخلف هم عزل شوند. نوبخت اعلام کرده با جدیت دنبال دستور رئیسجمهور برای پیگیری حقوقهای نجومی هستیم، البته آن طور که در فضای رسانهای مطرح شد 2 یا 3 مورد بیشتر نبود است.